Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms