Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH7Q9ULB5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH7Q9ULB5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH7Q9ULB5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.7 ms