Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms