Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms