Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLKQ9UBT6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms