Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms