Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms