Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC24A3Q9HC58 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms