Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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