Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms