Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms