Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms