Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIOK2Q9BVS4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms