Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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