Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms