Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms