Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms