Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 EIF3CL-202ENST00000398944 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AP000894.2-201ENST00000581719 3902 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FAAP24-202ENST00000588258 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TRIM36-207ENST00000513154 4218 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SLC27A6-202ENST00000395266 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AC010307.3-202ENST00000515122 3142 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ACTN3-201ENST00000502692 3084 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms