Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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LRRIQ1Q96JM4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ1Q96JM4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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