Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A14Q96JA4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms