Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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