Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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