Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS3Q8IXF0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms