Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms