Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP34Q70CQ2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP34Q70CQ2 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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