Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RFPL4BQ6ZWI9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms