Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms