Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms