Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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