Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUPD1Q68J44 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms