Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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