Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDRF1Q3B7T1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms