Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms