Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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