Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms