Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TCEA2Q15560 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms