Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms