Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.629e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.333e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-16■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CENPBD1P1-202ENST00000473164 944 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-9■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-9■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.393e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-205ENST00000553373 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CENPBD1P1-206ENST00000493504 3282 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.622e-9■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-207ENST00000553768 791 ntTSL 35.57□□□□□ -1.523e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-215ENST00000635305 2482 ntTSL 53.67□□□□□ -1.823e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 FERMT2-208ENST00000554152 3029 ntTSL 53.15□□□□□ -1.93e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CS-213ENST00000548746 551 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.655e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SMTN-212ENST00000455608 648 ntTSL 320.05■□□□□ 0.84e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.799e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-37■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.895e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.61e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.984e-12■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.761e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 219.21■□□□□ 0.671e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 518.62■□□□□ 0.571e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.021e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 310.2□□□□□ -0.781e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 THAP8-202ENST00000522483 1084 ntTSL 222.8■■□□□ 1.244e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PRR14-206ENST00000564946 2117 ntTSL 218.05■□□□□ 0.484e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PRR14-211ENST00000568754 856 ntTSL 316.87■□□□□ 0.294e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC25A44-204ENST00000469537 6952 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 BOLA3-AS1-203ENST00000533563 1599 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 BOLA3-AS1-201ENST00000423477 1804 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.091e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-10■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.584e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.424e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.034e-14■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 TMEM201-203ENST00000416541 3447 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 NFIA-211ENST00000482020 552 ntTSL 34.93□□□□□ -1.625e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 RBBP6-210ENST00000568015 695 ntTSL 315.24■□□□□ 0.034e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 524.48■■□□□ 1.515e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 321.41■■□□□ 1.025e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 514.1□□□□□ -0.155e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 57.26□□□□□ -1.255e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 47.25□□□□□ -1.255e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 46.55□□□□□ -1.365e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 55.75□□□□□ -1.495e-7■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.449e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.329e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 45.86□□□□□ -1.479e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.39□□□□□ -1.719e-8■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.626e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.566e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 317.97■□□□□ 0.476e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.316e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.576e-13■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 STARD10-207ENST00000536377 798 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 14.1
PCBP2Q15366 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-18■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MBD6-207ENST00000548887 568 ntTSL 413.88□□□□□ -0.191e-18■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-217ENST00000551455 2014 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TYK2-217ENST00000531620 586 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-209ENST00000547815 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-214ENST00000550186 1977 ntTSL 210.77□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-216ENST00000551209 2127 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GIT2-218ENST00000551721 2362 ntTSL 59.24□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SLC5A9-205ENST00000471020 1989 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CADM1-219ENST00000545960 630 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-15■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ATF7-207ENST00000551087 576 ntTSL 47.68□□□□□ -1.181e-9■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-9■■□□□ 14
PCBP2Q15366 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-9■■□□□ 14
PCBP2Q15366 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-9■■□□□ 14
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