Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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