Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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