Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TOP3AQ13472 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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