Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 36.27□□□□□ -1.413e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 25.11□□□□□ -1.593e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 511.98□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-206ENST00000494752 789 ntTSL 310.8□□□□□ -0.683e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.93e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-205ENST00000466152 1097 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.163e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 MUM1-203ENST00000586067 500 ntTSL 426.7■■□□□ 1.867e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-207ENST00000588888 1264 ntTSL 322.7■■□□□ 1.227e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-212ENST00000591453 2453 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.77e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-207ENST00000543714 567 ntTSL 217.02■□□□□ 0.327e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-205ENST00000587460 2793 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.37e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-213ENST00000591627 1461 ntTSL 215.62■□□□□ 0.097e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-206ENST00000431368 3050 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CHD4-203ENST00000535717 660 ntTSL 214.2□□□□□ -0.147e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-203ENST00000539330 608 ntTSL 212.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-205ENST00000541027 536 ntTSL 412.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-206ENST00000542615 538 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.377e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.467e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.937e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 26.61□□□□□ -1.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-204ENST00000467032 592 ntTSL 24.89□□□□□ -1.637e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.633e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-202ENST00000417736 2163 ntTSL 227.35■■□□□ 1.973e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.523e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-204ENST00000586691 359 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.674e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TMEM97-204ENST00000582384 1075 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MED15-220ENST00000461076 826 ntTSL 316.22■□□□□ 0.193e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-26■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-208ENST00000564966 1122 ntTSL 230.84■■■□□ 2.533e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-206ENST00000563597 815 ntTSL 330.03■■■□□ 2.43e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-213ENST00000568810 1080 ntTSL 230.03■■■□□ 2.43e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-212ENST00000567828 742 ntTSL 327.55■■■□□ 23e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-211ENST00000567642 658 ntTSL 225.46■■□□□ 1.673e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 524.75■■□□□ 1.553e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-210ENST00000567040 879 ntTSL 221.34■■□□□ 1.013e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.933e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-204ENST00000563065 1450 ntTSL 220.59■□□□□ 0.893e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-215ENST00000569745 1356 ntTSL 519.75■□□□□ 0.753e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.637e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 218.2■□□□□ 0.53e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.497e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MED15-212ENST00000436496 393 ntTSL 317.67■□□□□ 0.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.313e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.197e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-206ENST00000565296 1831 ntTSL 216.26■□□□□ 0.193e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-209ENST00000486263 708 ntTSL 216.11■□□□□ 0.177e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 515.73■□□□□ 0.117e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-208ENST00000535459 581 ntTSL 214.57□□□□□ -0.083e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-207ENST00000479207 1112 ntTSL 313.74□□□□□ -0.217e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.377e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.387e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.413e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 312.41□□□□□ -0.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-202ENST00000444658 1479 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.747e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 29.01□□□□□ -0.977e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-213ENST00000541573 573 ntTSL 48.06□□□□□ -1.123e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-207ENST00000565958 750 ntTSL 26.99□□□□□ -1.293e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.37e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MRPL42-209ENST00000552326 567 ntTSL 46.77□□□□□ -1.337e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.284e-10■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.327e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.67e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 525■■□□□ 1.593e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.394e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.383e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.142e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.965e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.855e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 520.02■□□□□ 0.87e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA1-212ENST00000532256 588 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 8
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