Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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