Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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