Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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