Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDH17Q12864 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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