Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC8Q09428 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms