Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TFF3Q07654 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TFF3Q07654 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TFF3Q07654 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TFF3Q07654 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TFF3Q07654 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TFF3Q07654 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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