Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms