Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ID3Q02535 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ID3Q02535 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms